本发明提供一种化学试剂样品容器的自动旋盖系统及方法，系统包括：旋盖机器人，所述旋盖机器人的两侧分别设置有第一试剂盒和第二试剂盒，所述第一试剂盒内设置有储液瓶，所述第二试剂盒内设置有瓶盖；所述旋盖机器人包括夹爪和旋转电爪，所述夹爪用以夹起储液瓶和瓶盖，所述旋转电爪用以固定储液瓶和旋转储液瓶；主控系统，所述主控系统建立坐标系并标定储液瓶、瓶盖、夹爪和旋转电爪在坐标系中的位置；所述主控系统接收控制信号并根据控制信号中相应目标在坐标系中的位置生成控制指令，所述主控系统通过控制指令控制旋盖机器人进行旋盖操作。本发明能够准确地密封储液瓶，无需其他复杂技术，也避免了化学实验人员难以完成的编程操作。