本发明提供一种基于数字孪生的高通量化学实验机器人自主管理调度系统，涉及机器人控制技术领域，包括数字孪生单元和生产执行单元；所述生产执行单元用以输入生产指令并输出第一生产指令信号，所述生产执行单元根据第一生产指令信号和第二生产指令信号控制机器人进行化学实验操作，所述生产执行单元将生产结果信号反馈至数字孪生单元。本发明通过数字孪生单元不断采集高通量化学实验整体的运行数据和仿真数据，并持续地完善整个实验相关的设备孪生模型，再将这些数据与生产执行单元进行交互，为提高高通量化学实验的效率和实验样品产出提供了数据支持，也为整个系统的决策优化提供了基础。